氣相色譜中多種氣體：載體氣體、氣體、輔助氣體等純度直接影響色譜儀的柔韌性、穩定性和柱壽命(當柱子效果是原來的1/10時，要改變新的色溫。)因此，要嚴格控制氣體的質量和雜質的去除。燃氣管道不能使用塑料管道。
橡膠管。
氧氣是大部分毛細管柱的天敵。在室溫或室溫下長期暴露在氧氣中，彩補熱不會受損。但是，如果柱子溫度升高，可能造成嚴重損傷。
2.水分：
對于毛細管柱，不建議枯燥、注水，使用厚液膜也不建議采用。水力會導致一些固定相發作，水解破壞產生光譜柱、噪音、尾隨峰或幽靈峰。
3.質量請求：
純度大于99.999%，FID的TCD大于99.999%就可以了。另外，使用鋼瓶時，當瓶子里的壓力在3~5個以下時要注意。
要換鋼瓶。因為瓶底的雜質很多，所以色差計的背景值很高。
考慮到左右因素，氣體在氣相色譜系統中必須嚴格凈化。但是設備仍然需要注意一些技巧。否則就達不到預期效果。無論是串行、并行、混合式，凈化器都要靠近儀器，首先要設置枯燥的管道，然后再設置脫氧管。早期裝置或通風醬汁要先沖洗過濾器。關于脫產管，首先要裝上空氣，然后張開另一口。由于裝載不同，影響也不同，所以應該這樣做。
三個影響因素思索：峰型擴張(與裝載機分子量和流速相關，分子量大，柱子效率高)，柱子壓降(與裝載機粘度相關)，檢查測量儀的柔韌性(熱導率對熱傳導池的影響)。典型的選擇如下：如果裝載器使用較低的線速，建議使用氮作為裝載器。高線速度氣相色譜儀好用氫氣載波氣體；在大壓力下使用氫氣比較好。另外，氣體流速對色譜儀的柱效應有差不多的影響，根據公式u=L/t0，通過實驗確認了。
